利改稅的缺陷如下所示：

“利改稅”在指導(dǎo)思想上企圖通過稅收一種分配形式來處理國家與國有企業(yè)的分配關(guān)系，強(qiáng)調(diào)了國家的社會管理者身份，忽視了國家的資產(chǎn)所有者身份；

強(qiáng)調(diào)了國家所擁有的政治權(quán)力，忽視了國家所擁有的經(jīng)濟(jì)權(quán)力；

強(qiáng)調(diào)了稅收形式的地位，忽視乃至否定了利潤上繳形式存在的合理性和必然性，事實(shí)上混淆了國家對于國有企業(yè)所具有的雙重身份、擁有的雙重權(quán)力，混淆了“稅”和“利”兩種性質(zhì)不同的分配形式。

雖然“利改稅”之前的國有企業(yè)利潤分配制度過于強(qiáng)調(diào)利潤上繳形式的重要性而否定稅收分配形式的合理性存在嚴(yán)重的局限，但“利改稅”對它的修正卻走向了另一個(gè)極端，即過于強(qiáng)調(diào)稅收分配形式的重要性，而否定了利潤上繳形式存在的必然性。

因此，“利改稅”及其以前的國有企業(yè)利潤分配制度都未能科學(xué)合理地處理國家與國有企業(yè)之間的分配關(guān)系。